马克思主义学院前身为2006年8月独立设置的直属学校的公共课教学部。2008年3月，因学校机构设置调整，思想政治理论课教学部成立，属于学院二级建制，负责学校思想政治理论课的教学和管理。2011年12月，学校成立直属学院党委的思想政治理论课教学部党支部。2021年11月，在思想政治理论课教学部的基础上成立马克思主义学院。马克思主义学院下设九个教研组，分别为《习近平新时代中国特色社会主义思想概论》教研组、《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》教研组、《马克思主义基本原理》教研组、《思想道德与法治》教研组、《中国近现代史纲要》教研组、《形势与政策》教研组、《军事理论》教研组、《国家安全教育》教研组、《走在前列的广东实践》教研组。

学院坚持牢牢把握“为党育人、为国育才”的初心使命，坚持“马院姓马、在马言马”，紧紧围绕“政治建院、教学立院、科研兴院、人才强院、文化润院”的价值理念，在思想政治理论课教学、马克思主义理论学科建设、师资队伍建设、人才培养模式、教科研成果、社会服务等方面取得一系列成果。